既存のHTMLファイルをちょっとだけ書き換るために、Perl で JavaScript または jQuery 風セレクタで（＝正規表現でいちいち探さないで） DOM を操作する事ってできるのかな？と思って調査した結果。モジュール候補をリストアップしただけの未テスト。

jQuery ライクに DOMを抽出、操作できる Mojo::DOM

書き換えもできるけれど他の部分には手をつけない（と書いてある）。
https://metacpan.org/pod/Mojo::DOM

ネイティブ JavaScript ライクに DOMを抽出、操作できる HTML::DOM

書き換え（オブジェクト変更後に書き出し）もできるけど、結果がどうなるか未テスト。
改行つぶされたりするとそれはそれでやりにくいからね。ドキュメントをざっと見て普通に考えるとあまり期待できない。
https://metacpan.org/pod/HTML::DOM

Perl で HTML をパースする（参考にした情報）

調査にあたり、下記のページの情報が役に立ちました。

Parsing HTML with Perl – O’Reilly Radar

以下は、このページ内で紹介されている関連情報。

タグ、その中の情報を抽出したいなら以下が便利。
https://metacpan.org/pod/HTML::TokeParser::Simple
https://metacpan.org/pod/HTML::TableExtract

XPath でノードを抽出する
https://metacpan.org/pod/HTML::TreeBuilder::XPath

Parse でエラーが出るなら前処理に役に立つかも
https://metacpan.org/pod/HTML::Tidy

HTMLがXML形式なら（ストリーム型パーサーだけど XPath も使える）
（荒野で拾ってきたXHTMLには多分使えない。）
https://metacpan.org/pod/XML::Twig